Iset Ta-Hemdjert qua đời trong khoảng thời gian cai trị của con trai bà, thi hài sau đó được chôn cất tại ngôi mộ QV51[2]. Ngôi mộ này được xây bắt đầu từ thời Ramesses III chồng bà và hoàn thiện vào thời Ramesses VI. Ngôi mộ đã bị trộm đột nhập nhiều lần, được đề cập trong cuộn giấy Abbott Papyrus vào Vương triều thứ 20[4].

QV51 bao gồm một hành lang kéo dài từ lối vào đến sảnh chính với 2 dãy phòng chôn cất. Những khung cảnh dọc hành lang cho thấy Iset đang đứng trước các thần Ptah-Sokar, Atum và Osiris. Trên những khung cửa và các dãy phòng, Vương hậu xuất hiện cùng với nhiều vị thần tối cao khác như Shu, Neith, Serket, Isis và Nephthys. Trên đó có những dòng chữ do chính tay Ramesses VI viết lên[5].

Những mảnh vỡ của cỗ quan tài bằng đá hoa cương đỏ được tìm thấy bởi nhà nghiên cứu Schiaparelli, hiện được cất giữ tại Bảo tàng Museo Egizio thuộc Ý.